В старинном ирландском травнике упоминалось, что фиалка трехцветная снижает спастические конвульсии у детей и помогает при повышенной температуре и воспалениях. Традиционная медицина, однако, не очень высоко ценит это растение, так как в нем не содержатся вещества, имеющие фармацевтические свойства. Но в народной медицине оно применяется при угревой сыпи, нечистой коже и перхоти. Полагают, что чай из фиалки трехцветной очищает кровь, понижает температуру и уменьшает воспалительные процессы в горле. Гомеопатические препараты используются при экземах.